Les Jeunes Démocrates disposent ainsi de leurs propres structures et choisissent eux-mêmes leurs responsables :

 Un Président national élu pour deux ans au suffrage universel des adhérents.
 Un Bureau national élu en même temps que le Président et chargé de l’animation quotidienne du mouvement
 Un Conseil national formé de membres élus au sein de chaque fédération, qui tient régulièrement des réunions thématiques.

Au niveau de chaque département existe une fédération des Jeunes Démocrates organisée de manière similaire :

 Le Président fédéral est élu pour deux ans par l’ensemble des adhérents de la fédération
 Le Bureau fédéral est élu en même temps que le Président et chargé de l’animation de la fédération.